该阶段全部内容在临床医院的临床科室完成，学生在完成第二阶段药学实践的基础上，可以根据个人兴趣选择临床药学某个专业方向进行较深入的专科临床药学实践，实践的临床科室根据该专业方向的需要选择相关的一个或几个临床科室，实践时间为4-5个月。学生通过在老师的指导下参与日常医疗活动，强化临床思维，在所选择的专业方向上，培养处理复杂临床药物治疗问题的能力和独立工作能力。